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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4jccA_ | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: iron-compound abc transporter, iron-compound-binding | PDBTitle: crystal structure of iron uptake abc transporter substrate-binding2 protein piua from streptococcus pneumoniae canada mdr_19a |
Added to library: Sat Mar 9 08:35:21 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | A | P | T | E | V | T | I | K | S | S | L | D | E | V | K | L | S | K | V | P | E | K | I | V | T | F | D | L | G | A | A | D | T | I | R | A | L | G | F | A | K | N | I | V | G | M | P | T | K | T | V | P | T | Y | L | K | D | L | V | G | T | V | K | N | V | G | S | M | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | G | G | G | S | S | G | G | G | G | G | G | G | G | G | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | P | D | L | E | A | I | A | A | L | E | P | D | L | I | I | A | S | P | R | T | Q | K | F | V | D | K | F | K | E | I | A | P | T | V | L | F | Q | A | S | K | D | D | Y | W | T | S | T | K | A | N | I | E | S | L | A | S | A | F | G | E | T | G | T | Q | K | A | K | E | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | S | G | G | G | G | G | G | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | A | K | L | D | E | S | I | Q | E | V | A | T | K | N | E | S | S | D | K | K | A | L | A | I | L | L | N | E | G | K | M | A | A | F | G | A | K | S | R | F | S | F | L | Y | Q | T | L | K | F | K | P | T | D | T | K | F | E | D | S | R | H | G | Q | E | V | S | F | E | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | K | E | I | N | P | D | I | L | F | V | I | N | R | T | L | A | I | G | G | D | N | S | S | N | D | G | V | L | E | N | A | L | I | A | E | T | P | A | A | K | N | G | K | I | I | Q | L | T | P | D | L | W | Y | L | S | G | G | G | L | E | S | T | K | L | M | I | E | D | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | G | G | G | G | T | T | S | T | T | S | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Q | K | A | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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