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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4j8zB_ | PDB header: protein binding | Chain: B: PDB Molecule: speckle-type poz protein; | PDBTitle: crystal structure of the human spop btb domain |
Added to library: Sat Sep 14 08:29:04 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | V | K | V | P | E | C | R | L | A | D | E | L | G | G | L | W | E | N | S | R | F | T | D | C | C | L | C | V | A | G | Q | E | F | Q | A | H | K | A | I | L | A | A | R | S | P | V | F | S | A | M | F | E | H | E | M | E | E | S | K | K | N | R | V | E | I | N | D | V | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | E | V | F | K | E | M | M | C | F | I | Y | T | G | K | A | P | N | L | D | K | M | A | D | D | L | L | A | A | A | D | K | Y | A | L | E | R | L | K | V | M | C | E | D | A | L | C | S | N | L | S | V | E | N | A | A | E | I | L | I | L | A | D | L | H | S | A | D | Q | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | G | G | G | S | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||
Sequence | K | T | Q | A | V | D | F | I | N | Y | H | A | S | D | V | L | E | T | S | G | W | K | S | M | V | V | S | H | P | H | L | V | A | E | A | E | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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