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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4j8lA_ | PDB header: unknown function | Chain: A: PDB Molecule: uncharacterized protein yhfs; | PDBTitle: crystal structure of the pyridoxal-5'-phosphate dependent protein yhfs2 from escherichia coli |
Added to library: Sat Mar 8 08:20:16 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | X | K | T | F | P | L | Q | S | L | T | I | I | E | A | Q | Q | K | Q | F | A | L | V | D | S | I | C | R | H | F | P | G | S | E | F | L | T | G | G | D | L | G | L | T | P | G | L | N | Q | P | R | V | T | Q | R | V | E | Q | V | L | A | D | A | F | H | A | Q | A | A | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | T | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | Q | G | A | G | T | G | A | I | R | A | G | L | A | A | L | L | K | P | G | Q | R | L | L | V | H | D | A | P | V | Y | P | T | T | R | V | I | I | E | Q | X | G | L | T | L | I | T | V | D | F | N | D | L | S | A | L | K | Q | V | V | D | E | Q | Q | P | D | A | A | L | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | H | T | R | Q | Q | P | Q | D | S | Y | V | L | A | D | V | L | A | T | L | R | A | A | G | V | P | A | L | T | D | D | N | Y | A | V | X | K | V | A | R | I | G | C | E | C | G | A | N | V | S | T | F | S | C | F | L | F | G | P | E | G | V | G | A | V | V | G | D | A | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | I | N | R | I | R | A | T | L | Y | S | G | G | S | Q | I | Q | G | A | Q | A | L | E | V | L | R | G | L | V | F | A | P | V | X | H | A | V | Q | A | G | V | S | E | R | L | L | A | L | L | N | G | G | A | V | P | E | V | K | S | A | V | I | A | N | A | Q | S | K | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | I | V | E | F | H | Q | P | I | A | A | R | V | L | E | E | A | Q | K | R | G | A | L | P | Y | P | V | G | A | E | S | K | Y | E | I | P | P | L | F | Y | R | L | S | G | T | F | R | Q | A | N | P | Q | S | E | H | C | A | I | R | I | N | P | N | R | S | G | E | E | T | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | B | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | I | L | R | E | S | I | A | S | I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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