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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4j5uB_ | PDB header: transferase | Chain: B: PDB Molecule: serine hydroxymethyltransferase; | PDBTitle: x-ray crystal structure of a serine hydroxymethyltransferase with2 covalently bound plp from rickettsia rickettsii str. sheila smith |
Added to library: Sat Mar 16 08:21:14 2013 | |
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Sequence | M | N | I | F | N | N | N | L | H | E | T | D | K | E | I | N | E | I | I | K | H | E | K | L | R | Q | S | S | V | I | E | L | I | A | S | E | N | F | V | S | P | A | V | L | E | A | Q | G | A | L | L | T | N | K | Y | A | E | G | Y | P | S | K | R | F | Y | N | G | C | E | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | T | G | G | G | G | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | D | K | A | E | N | L | A | I | E | R | V | K | K | L | F | N | C | K | Y | A | N | V | Q | P | H | S | G | S | Q | A | N | Q | A | V | Y | L | A | L | L | Q | P | G | D | T | V | L | G | M | S | L | D | S | G | G | H | L | T | H | G | A | A | P | N | M | S | G | K | W | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | A | V | S | Y | S | V | N | K | E | T | Y | L | I | D | Y | D | E | I | E | R | L | A | D | L | H | K | P | K | L | L | I | A | G | F | S | A | Y | P | R | N | I | D | F | A | K | F | R | E | I | V | D | K | V | G | A | Y | F | M | A | D | I | A | H | I | A | G | L | V | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | G | E | H | Q | S | P | I | P | Y | A | H | A | V | T | S | T | T | H | T | L | R | G | P | R | G | G | L | I | L | S | N | D | E | E | I | G | H | K | I | N | S | A | L | F | P | G | L | Q | G | G | P | L | M | H | I | I | A | A | K | A | V | A | F | L | E | N | L | Q | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | E | Y | K | S | Y | I | Q | Q | V | I | S | N | A | K | A | L | A | S | S | L | Q | E | R | G | Y | D | I | L | T | G | G | T | D | N | H | I | V | L | V | D | L | R | K | D | G | I | T | G | K | L | A | A | N | S | L | D | R | A | G | I | T | C | N | K | N | A | I | P | F | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | S | S | G | G | G | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 400 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 410 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | E | T | S | P | F | I | T | S | G | I | R | L | G | T | P | A | C | T | T | R | G | F | K | E | K | D | F | V | L | V | G | H | M | V | A | D | I | L | D | G | L | K | N | N | E | D | N | S | A | L | E | Q | Q | V | L | N | E | V | T | K | L | I | E | L | F | P | F | Y | G | |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S |
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