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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4j4wA_ | PDB header: viral protein | Chain: A: PDB Molecule: nucleocapsid; | PDBTitle: crystal structure of buevn |
Added to library: Sat May 25 08:33:05 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | S | Y | E | E | I | A | I | Q | F | A | S | E | S | V | D | A | T | T | I | A | A | W | V | S | E | F | A | Y | Q | G | F | D | A | R | Q | V | I | N | L | V | K | Q | R | G | G | D | D | W | K | E | D | V | K | K | M | I | V | L | S | L | T | R | G | N | K | P | S | K | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | N | K | M | S | E | S | G | Q | K | I | V | N | D | L | I | S | K | Y | K | L | K | S | G | N | P | G | R | N | D | L | T | L | S | R | I | A | A | A | F | A | G | W | T | C | Q | A | A | E | V | V | Q | D | Y | L | P | V | T | G | R | A | M | D | A | I | S | D | K | F | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | B | S | S | T | T | B | T | T | G | G | G | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | A | L | M | H | P | S | F | A | G | L | V | D | P | T | L | P | E | G | V | V | E | D | I | V | H | A | H | C | L | F | M | I | Q | F | S | K | T | I | N | P | S | L | R | S | S | S | K | S | E | V | V | S | S | F | D | R | P | M | Q | A | A | I | N | S | P | F | L | T | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | G | G | G | G | G | G | T | T | S | G | G | G | T | T | S | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | ||||||||||
Sequence | G | N | R | R | D | I | L | M | S | L | G | L | I | N | S | N | L | K | P | S | P | T | V | V | A | A | A | K | V | Y | R | K | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | T | T | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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