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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4j3zE_ | PDB header: isomerase | Chain: E: PDB Molecule: mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme; | PDBTitle: crystal structure of mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme2 from jannaschia sp. ccs1 |
Added to library: Sat Mar 9 08:27:28 2013 | |
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Sequence | M | V | K | L | D | T | L | D | I | F | A | V | A | P | P | P | P | G | W | G | G | R | Y | W | L | L | V | R | V | T | T | D | T | G | L | T | G | L | G | E | V | Y | A | A | G | V | G | P | E | A | M | T | H | V | I | H | D | V | F | T | R | H | M | R | G | E | D | P | A | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | E | L | M | S | R | R | A | H | S | S | G | F | T | Q | R | P | D | P | T | V | F | G | A | F | S | G | L | E | M | A | C | W | D | I | L | G | K | A | R | D | C | P | V | W | A | M | L | G | G | K | M | N | D | R | I | R | A | Y | T | Y | L | Y | P | E | P | H | H | D | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | S | B | G | G | G | G | T | T | S | S | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | A | F | W | T | S | P | E | M | A | A | E | S | A | A | A | R | V | A | E | G | Y | T | A | V | K | F | D | P | A | G | P | Y | T | M | R | G | G | H | M | P | A | L | S | D | I | D | L | S | A | R | F | C | A | A | I | R | D | A | V | G | T | Q | A | D | L | L | F | G | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | T | S | S | T | T | S | B | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | H | G | Q | F | A | P | A | G | A | I | R | L | A | K | A | I | E | P | Y | D | P | L | W | Y | E | E | P | I | P | P | D | N | L | P | G | L | S | E | V | A | A | H | T | S | I | P | I | A | T | G | E | R | L | T | G | V | T | E | F | T | Q | A | L | H | H | G | A | R | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | G | G | G | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | Q | P | A | L | G | R | A | G | G | I | W | E | G | K | K | I | A | T | L | A | A | A | F | G | A | Q | L | A | P | H | L | Y | A | G | P | V | E | W | A | A | N | V | H | L | G | V | S | C | P | N | L | L | M | V | E | A | I | E | T | P | F | H | E | A | L | V | T | G | R | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | B | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | R | V | E | N | G | F | V | A | A | P | D | A | P | G | L | G | I | T | L | N | D | A | I | A | N | A | H | R | Y | T | G | N | R | L | H | L | E | M | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | S | B | T | S | T | B | S | S |
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