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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4j1jA_ | PDB header: viral protein/dna | Chain: A: PDB Molecule: nucleocapsid; | PDBTitle: leanyer orthobunyavirus nucleoprotein-ssrna complex |
Added to library: Sat Apr 13 08:22:31 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | G | P | D | F | I | Y | D | D | R | P | A | A | V | S | S | T | F | N | P | E | K | G | Y | M | D | F | I | T | A | Y | G | K | N | I | N | A | D | N | V | R | I | F | F | L | N | H | K | K | A | K | D | S | L | K | G | S | P | K | V | E | V | D | L | Q | F | G | T | L | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | K | V | V | N | N | H | N | P | R | N | R | D | N | P | V | A | D | N | A | I | T | L | H | R | L | S | G | Y | L | A | K | W | C | F | D | E | I | D | H | G | Q | I | E | E | A | E | V | K | S | K | V | V | I | P | L | A | E | A | K | G | C | K | W | G | D | G | V | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | L | A | F | A | P | G | A | E | M | F | L | K | D | F | E | F | Y | P | L | A | I | D | I | Q | R | V | V | K | D | G | M | D | I | T | F | M | R | K | V | L | K | Q | R | Y | G | T | K | T | A | D | D | W | M | I | S | E | V | T | A | I | Q | S | A | V | K | V | V | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | G | G | G | G | T | T | T | T | T | T | G | G | G | G | T | T | T | T | T | B | T | T | B | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | ||||||||||||||||||
Sequence | L | P | W | A | K | A | G | F | T | A | A | A | K | N | F | L | A | K | F | N | I | S | V | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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