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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4izhA_ | PDB header: oxidoreductase | Chain: A: PDB Molecule: nad/nadp transhydrogenase alpha subunit 1; | PDBTitle: crystal structure of the alpha1 dimer of thermus thermophilus2 transhydrogenase in p6 |
Added to library: Sat Feb 1 08:24:06 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | V | T | V | A | V | P | K | E | R | A | P | G | E | R | R | V | A | L | V | P | E | V | V | A | R | L | V | K | G | G | A | R | V | R | V | E | R | G | A | G | E | G | A | Y | H | P | D | E | A | Y | Q | E | A | G | A | E | V | V | E | R | G | E | L | L | K | G | A | H | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | F | T | V | Q | P | P | P | E | D | L | I | Q | A | L | E | P | G | A | I | V | V | G | F | V | Q | P | H | K | N | L | E | L | V | R | A | L | Q | A | K | K | A | T | V | I | A | M | E | L | I | P | R | I | T | R | A | Q | S | M | D | A | L | S | S | Q | A | T | V | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | G | G | G | G | G | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | L | A | A | I | H | A | A | R | L | S | P | R | F | F | P | M | L | T | T | A | A | G | T | I | R | P | A | K | V | M | V | M | G | V | G | V | A | G | L | M | A | I | A | T | A | K | R | L | G | A | Q | V | F | A | Y | D | V | R | K | A | A | L | E | Q | A | L | S | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | K | P | I | E | L | P | I | S | A | E | L | T | E | E | E | K | R | I | Q | H | E | A | L | R | D | H | V | A | G | M | D | V | L | I | T | T | A | Q | V | P | G | R | R | A | P | I | L | L | T | E | D | M | V | E | R | L | K | P | G | T | V | V | V | D | L | A | A | E | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | T | T | S | B | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | G | G | N | C | V | L | T | K | P | G | E | V | V | E | V | R | G | V | R | V | Y | G | P | L | N | L | P | S | E | L | S | V | H | A | S | E | M | Y | A | K | N | L | Y | N | L | S | S | L | L | I | E | K | G | A | F | A | P | K | W | E | D | E | I | V | R | A | A | L | L | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | B | T | T | B | T | T | T | B | T | G | G | G | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | E | G | E | V | L | H | G | P | T | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T |
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