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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4iu3B_ | PDB header: structural protein | Chain: B: PDB Molecule: cellulose-binding protein; | PDBTitle: cohesin-dockerin -x domain complex from ruminococcus flavefacience |
Added to library: Sat Apr 27 08:23:07 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | T | V | T | S | A | V | K | T | Q | Y | V | E | I | E | S | V | D | G | F | Y | F | N | T | E | D | K | F | D | T | A | Q | I | K | K | A | V | L | H | T | V | Y | N | E | G | Y | T | G | D | D | G | V | A | V | V | L | R | E | Y | E | S | E | P | V | D | I | T | A | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | F | G | D | A | T | P | A | N | T | Y | K | A | V | E | N | K | F | D | Y | E | I | P | V | Y | Y | N | N | A | T | L | K | D | A | E | G | N | D | A | T | V | T | V | Y | I | G | L | K | G | D | T | D | L | N | N | I | V | D | G | R | D | A | T | A | T | L | T | Y | Y | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | S | S | B | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | T | S | T | D | G | K | D | A | T | T | V | A | L | S | P | S | T | L | V | G | G | N | P | E | S | V | Y | D | D | F | S | A | F | L | S | D | V | K | V | D | A | G | K | E | L | T | R | F | A | K | K | A | E | R | L | I | D | G | R | D | A | S | S | I | L | T | F | Y | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | S | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||
Sequence | K | S | S | V | D | Q | Y | K | D | M | A | A | N | E | P | N | K | L | W | D | I | V | T | G | D | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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