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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4iu2A_ | PDB header: structural protein | Chain: A: PDB Molecule: cell-wall anchoring protein; | PDBTitle: cohesin-dockerin -x domain complex from ruminococcus flavefacience |
Added to library: Sat Apr 27 08:21:32 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | H | H | H | H | A | X | A | L | T | D | R | G | X | T | Y | D | L | D | P | K | D | G | S | S | A | A | T | K | P | V | L | E | V | T | K | K | V | F | D | T | A | A | D | A | A | G | Q | T | V | T | V | E | F | K | V | S | G | A | E | G | K | Y | A | T | T | G | Y | H | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | W | D | E | R | L | E | V | V | A | T | K | T | G | A | Y | A | K | K | G | A | A | L | E | D | S | S | L | A | K | A | E | N | N | G | N | G | V | F | V | A | S | G | A | D | D | D | F | G | A | D | G | V | X | W | T | V | E | L | K | V | P | A | D | A | K | A | G | D | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | Y | P | I | D | V | A | Y | Q | W | D | P | S | K | G | D | L | F | T | D | N | K | D | S | A | Q | G | K | L | X | Q | A | Y | F | F | T | Q | G | I | K | S | S | S | N | P | S | T | D | E | Y | L | V | K | A | N | A | T | Y | A | D | G | Y | I | A | I | K | A | G | E | P | |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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