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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ithB_ | PDB header: transferase/transferase inhibitor | Chain: B: PDB Molecule: receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1; | PDBTitle: crystal structure of rip1 kinase in complex with necrostatin-1 analog |
Added to library: Sat Mar 16 09:44:41 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | N | V | I | K | M | K | S | S | D | F | L | E | S | A | E | L | K | V | S | L | A | F | H | R | T | Q | G | L | M | I | M | K | T | V | Y | K | G | P | N | C | I | E | H | N | E | A | L | L | E | E | A | K | M | M | N | R | L | R | H | S | R | V | V | K | L | L | G | V | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | B | S | B | T | T | T | S | T | T | T | B | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | E | E | G | K | Y | S | L | V | M | E | Y | M | E | K | G | N | L | M | H | V | L | K | A | E | M | S | T | P | L | S | V | K | G | R | I | I | L | E | I | I | E | G | M | A | Y | L | H | G | K | G | V | I | H | K | D | L | K | P | E | N | I | L | V | D | N | D | F | H | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | B | T | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | I | A | D | L | G | L | A | S | F | K | M | W | S | K | L | N | N | E | E | H | N | E | G | T | L | Y | Y | M | A | P | E | H | L | N | D | V | N | A | K | P | T | E | K | S | D | V | Y | S | F | A | V | V | L | W | A | I | F | A | N | K | E | P | Y | E | N | A | I | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | G | G | G | T | S | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 |
Sequence | Q | Q | L | I | M | A | I | K | S | G | N | R | P | D | V | D | D | I | T | E | Y | C | P | R | E | I | I | S | L | M | K | L | C | W | E | A | N | P | E | A | R | P | T | F | P | G | I | E | E | K | F | R | P | F | Y | L | S | Q | L | E | ||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | T | S | S | G | G | G | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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