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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4iqgB_ | PDB header: oxidoreductase | Chain: B: PDB Molecule: short-chain dehydrogenase/reductase sdr; | PDBTitle: crystal structure of bpro0239 oxidoreductase from polaromonas sp.2 js666 in nadp bound form |
Added to library: Mon Feb 4 12:59:27 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | K | V | V | L | I | T | G | G | S | R | G | I | G | A | A | S | A | L | L | A | A | R | Q | G | Y | A | V | A | V | N | Y | A | S | N | S | A | A | A | D | E | V | V | R | Q | I | R | E | A | G | G | Q | A | L | A | V | Q | A | D | V | A | K | E | R | E | V | L | A | X | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | T | V | D | A | Q | L | G | R | L | S | A | L | V | N | N | A | G | V | V | D | Q | T | T | R | V | D | G | I | T | L | E | R | L | Q | R | X | F | E | I | N | V | F | G | S | F | L | C | A | R | E | A | V | K | R | X | S | T | R | Y | G | G | S | G | G | S | I | V | N | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | G | G | G | T | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | S | A | A | A | R | L | G | S | P | G | Q | Y | V | D | Y | A | A | A | K | G | A | I | D | T | F | T | L | G | L | A | K | E | V | A | T | E | G | I | R | V | N | A | V | R | P | G | I | I | E | T | D | I | H | A | S | G | G | L | P | N | R | A | R | D | V | A | P | Q | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S | B | S | S | T | T | T | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||
Sequence | P | X | Q | R | A | G | T | A | R | E | V | A | E | A | I | V | W | L | L | G | D | Q | A | S | Y | T | T | G | A | L | L | D | V | T | G | G | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | B | S | G | G | G | T | T | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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