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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ioyX_ | PDB header: transcription | Chain: X: PDB Molecule: fact complex subunit spt16; | PDBTitle: structure of the spt16 middle domain reveals functional features of2 the histone chaperone fact |
Added to library: Sat Feb 23 08:24:43 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | K | R | L | D | Q | I | F | V | R | P | N | P | D | T | K | R | V | P | S | T | V | F | I | H | E | N | G | I | R | F | Q | S | P | L | R | T | D | S | R | I | D | I | L | F | S | N | I | K | N | L | I | F | Q | S | C | K | G | E | L | I | V | V | I | H | I | H | L | K | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | G | G | G | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | I | L | M | G | K | K | K | I | Q | D | V | Q | F | Y | R | E | A | S | E | D | E | L | E | Q | E | Q | E | E | R | R | K | R | A | A | L | D | K | E | F | K | Y | F | A | D | A | I | A | E | A | S | N | G | L | L | T | V | E | N | T | F | R | D | L | G | F | Q | G | V | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | G | G | G | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | R | S | A | V | F | C | M | P | T | T | D | C | L | V | Q | L | I | E | P | P | F | L | V | I | N | L | E | E | V | E | I | C | I | L | E | R | V | Q | F | G | L | K | N | F | D | M | V | F | V | Y | K | D | F | N | K | P | V | T | H | I | N | T | V | P | I | E | S | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | |||||||||||||
Sequence | F | L | K | Q | W | L | T | D | M | D | I | P | Y | T | V | S | T | I | N | L | N | W | A | T | I | M | K | S | L | Q | D | D | P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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