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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4io7A_ | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: avglur1 ligand binding domain; | PDBTitle: crystal structure of the avglur1 ligand binding domain complex with2 phenylalanine at 1.9 angstrom resolution |
Added to library: Sat Feb 23 08:46:15 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | S | A | R | L | K | G | I | T | L | R | I | G | V | I | E | S | V | P | F | T | I | V | A | N | V | I | R | N | T | T | K | L | T | G | Y | V | L | D | L | I | E | Y | L | R | D | K | M | G | F | V | A | D | V | Q | L | A | P | P | N | T | S | Y | T | G | L | V | L | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | T | B | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | N | G | D | Y | D | I | A | I | G | D | I | T | V | T | S | A | R | R | E | I | V | A | F | S | N | S | I | S | D | N | S | M | R | I | L | M | R | K | G | T | L | I | D | G | M | D | D | L | K | N | G | K | I | P | Y | N | R | I | G | I | R | I | G | T | A | G | E | D | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | B | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | S | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | L | R | E | I | S | G | G | S | R | N | F | Y | P | L | K | S | R | Q | E | M | Y | D | S | L | L | A | G | I | I | D | V | S | F | M | D | I | G | T | A | E | Y | V | T | N | N | I | Y | C | N | L | T | L | V | G | E | D | F | D | K | S | T | F | G | I | V | T | P | K | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||
Sequence | W | L | Y | A | K | D | L | D | V | N | I | L | S | L | R | E | T | G | I | L | D | N | L | K | K | K | W | F | Q | T | K | A | C | P | F | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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