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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4imiA_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: symplekin; | PDBTitle: novel modifications on c-terminal domain of rna polymerase ii can2 fine- tune the phosphatase activity of ssu72. |
Added to library: Sat Aug 10 08:31:59 2013 | |
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Sequence | M | T | D | E | K | T | A | T | A | R | A | K | V | V | D | W | C | N | E | L | V | I | A | S | P | S | T | K | C | E | L | L | A | K | V | Q | E | T | V | L | G | S | C | A | E | L | A | E | E | F | L | E | S | V | L | S | L | A | H | D | S | N | M | E | V | R | K | Q | V | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | F | V | E | Q | V | C | K | V | K | V | E | L | L | P | H | V | I | N | V | V | S | M | L | L | R | D | N | S | A | Q | V | I | K | R | V | I | Q | A | C | G | S | I | Y | K | N | G | L | Q | Y | L | C | S | L | M | E | P | G | D | S | A | E | Q | A | W | N | I | L | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | K | A | Q | I | L | D | M | I | D | N | E | N | D | G | I | R | T | N | A | I | K | F | L | E | G | V | V | V | L | Q | S | F | A | D | E | D | S | L | K | R | D | G | D | F | S | L | A | D | V | P | D | H | C | T | L | F | R | R | E | K | L | Q | E | E | G | N | N | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | S | T | T | S | T | T | G | G | G | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | I | L | L | Q | F | H | G | T | T | H | I | S | S | V | N | L | I | A | C | T | S | S | L | C | T | I | A | K | M | R | P | I | F | M | G | A | V | V | E | A | F | K | Q | L | N | A | N | L | P | P | T | L | T | D | S | Q | V | S | S | V | R | K | S | L | K | M | Q | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | ||||||||
Sequence | T | L | L | K | N | R | G | A | F | E | F | A | S | T | I | R | G | M | L | V | D | L | G | S | S | T | N | E | I | Q | K | L | I | P | K | M | D | K | Q | E | M | A | R | R | Q | K | R | I | L | E | N | A | ||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | G | G | G | G | G | G | T | T | T | T | S |
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