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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4im6A_ | PDB header: structural protein | Chain: A: PDB Molecule: nacht, lrr and pyd domains-containing protein 1; | PDBTitle: lrr domain from human nlrp1 |
Added to library: Sat Jan 11 09:33:06 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | T | D | A | Y | W | Q | I | L | F | S | V | L | K | V | T | R | N | L | K | E | L | D | L | S | G | N | S | L | S | H | S | A | V | K | S | L | C | K | T | L | R | R | P | R | C | L | L | E | T | L | R | L | A | G | C | G | L | T | A | E | D | C | K | D | L | A | F | G | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | A | N | Q | T | L | T | E | L | D | L | S | F | N | V | L | T | D | A | G | A | K | H | L | C | Q | R | L | R | Q | P | S | K | L | Q | R | L | Q | L | V | S | C | G | L | T | S | D | C | C | Q | D | L | A | S | V | L | S | A | S | P | S | L | K | E | L | D | L | Q | Q | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | S | T | T | S | B | G | G | G | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | N | L | D | D | V | G | V | R | L | L | C | E | G | L | R | H | P | A | C | K | L | I | R | L | G | L | D | Q | T | T | L | S | D | E | M | R | Q | E | L | R | A | L | E | Q | E | K | P | Q | L | L | I | F | S | R | R | K | P | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | S | T | T | T | T | S | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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