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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ifwA_ | PDB header: hydrolase/hydrolase inhibitor | Chain: A: PDB Molecule: thiamine biosynthesis lipoprotein apbe; | PDBTitle: crystal structure of treponema pallidum tp0796 fad processing protein,2 adp inhibited form |
Added to library: Sat Mar 2 08:31:03 2013 | |
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Sequence | R | V | R | E | Y | S | R | A | E | L | V | I | G | T | L | C | R | V | R | V | Y | S | K | R | P | A | A | E | V | H | A | A | L | E | E | V | F | T | L | L | Q | Q | Q | E | M | V | L | S | A | N | R | D | D | S | A | L | A | A | L | N | A | Q | A | G | S | A | P | V | V | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | R | S | L | Y | A | L | L | E | R | A | L | F | F | A | E | K | S | G | G | A | F | N | P | A | L | G | A | V | V | K | L | W | N | I | G | F | D | A | V | P | D | P | D | A | L | K | E | A | L | T | R | C | D | F | R | Q | V | H | L | R | A | G | V | S | V | G | A | P | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | T | T | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | V | Q | L | A | Q | A | G | M | Q | L | D | L | G | A | I | A | K | G | F | L | A | D | K | I | V | Q | L | L | T | A | H | A | L | D | S | A | L | V | D | L | G | G | N | I | F | A | L | G | L | K | Y | G | A | Q | R | L | E | W | N | V | G | I | R | D | P | H | G | T | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | Q | K | P | A | L | V | V | S | V | R | D | C | S | V | V | T | S | G | A | Y | E | R | F | F | E | R | D | G | V | R | Y | H | H | I | I | D | P | V | T | G | F | P | A | H | T | D | V | D | S | V | S | I | F | A | P | R | S | T | D | A | D | A | L | A | T | A | C | F | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | |||
Sequence | G | Y | E | K | S | C | A | L | L | R | E | F | P | G | V | D | A | L | F | I | F | P | D | K | R | V | R | A | S | A | G | I | V | D | R | V | R | V | L | D | A | R | F | V | L | E | R | |||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S |
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