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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4iefG_ | PDB header: hydrolase | Chain: G: PDB Molecule: gingipain r2 pro-domain; | PDBTitle: complex of porphyromonas gingivalis rgpb pro- and mature domains |
Added to library: Sat Apr 13 09:03:44 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | N | P | Q | V | R | L | L | S | A | E | Q | S | M | S | K | V | Q | F | R | M | D | N | L | Q | F | T | G | V | Q | T | S | K | G | V | A | Q | V | P | T | F | T | E | G | V | N | I | S | E | K | G | T | P | I | L | P | I | L | S | R | S | L | A | V | S | E | T | R | A | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | T | B | T | T | S | B | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | V | E | V | V | S | S | K | F | I | E | K | K | D | V | L | I | A | P | S | K | G | V | I | S | R | A | E | N | P | D | Q | I | P | Y | V | Y | G | Q | S | Y | N | E | D | K | F | F | P | G | E | I | A | T | L | S | D | P | F | I | L | R | D | V | R | G | Q | V | V | N | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | B | S | T | T | S | G | G | G | S | G | G | G | G | S | B | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 |
Sequence | A | P | L | Q | Y | N | P | V | T | K | T | L | R | I | Y | T | E | I | V | V | A | V | S | E | T | A | E | A | G | Q | N | T | I | S | F | T | G | F | E | D | I | Y | K | S | V | F | M | N | Y | E | ||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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