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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4i9yC_ | PDB header: transport protein | Chain: C: PDB Molecule: e3 sumo-protein ligase ranbp2; | PDBTitle: structure of the c-terminal domain of nup358 |
Added to library: Mon Feb 4 12:07:27 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | P | H | M | T | N | P | V | V | F | F | D | V | C | A | D | G | E | P | L | G | R | I | T | M | E | L | F | S | N | I | V | P | R | T | A | E | N | F | R | A | L | C | T | G | E | K | G | F | G | F | K | N | S | I | F | H | R | V | I | P | D | F | V | C | Q | G | G | D | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | B | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | K | H | D | G | T | G | G | Q | S | I | Y | G | D | K | F | E | D | E | N | F | D | V | K | H | T | G | P | G | L | L | S | M | A | N | Q | G | Q | N | T | N | N | S | Q | F | V | I | T | L | K | K | A | E | H | L | D | F | K | H | V | V | F | G | F | V | K | D | G | M | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | B | T | T | B | S | B | S | S | T | T | S | S | T | T | B | S | S | S | G | G | G | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||
Sequence | T | V | K | K | I | E | S | F | G | S | P | K | G | S | V | C | R | R | I | T | I | T | E | C | G | Q | I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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