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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4i9xB_ | PDB header: apoptosis | Chain: B: PDB Molecule: protein ul141; | PDBTitle: crystal structure of human cytomegalovirus glycoprotein ul1412 targeting the death receptor trail-r2 |
Added to library: Sat Apr 6 08:23:08 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | F | A | T | A | D | I | A | E | K | X | W | A | E | N | Y | E | T | T | S | P | A | P | V | L | V | A | E | G | E | Q | V | T | I | P | C | T | V | X | T | H | S | W | P | X | V | S | I | R | A | R | F | C | R | S | H | D | G | S | D | E | L | I | L | D | A | V | K | G | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | L | X | N | G | L | Q | Y | R | L | P | Y | A | T | W | N | F | S | Q | L | H | L | G | Q | I | F | S | L | T | F | N | V | S | T | D | T | A | G | X | Y | E | C | V | L | R | N | Y | S | H | G | L | I | X | Q | R | F | V | I | L | T | Q | L | E | T | L | P | A | L | G | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||
Sequence | Y | S | L | G | D | Q | I | W | S | P | T | P | W | R | L | R | N | H | D | C | G | F | Q | R | N | Y | F | Y | I | G | R | E | P | D | R | C | W | T | V | I | Q | R | Y | R | L | P | G | D | ||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | B | S | S | G | G | G | S | T | T | T | T | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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