|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4i7cC_ | PDB header: ligase/ligase inhibitor | Chain: C: PDB Molecule: e3 ubiquitin-protein ligase siah1; | PDBTitle: siah1 mutant bound to synthetic peptide (ace)klrpv(23p)mvrpwvr |
Added to library: Sat Aug 17 08:22:29 2013 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | A | N | S | V | L | F | P | C | K | Y | A | S | S | G | C | E | I | T | L | P | H | T | E | K | A | D | H | E | E | L | C | E | F | R | P | Y | S | C | P | C | P | G | A | S | C | K | W | Q | G | S | L | D | A | V | M | P | H | L | M | H | Q | H | K | S | I | C | T | L | Q | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | D | I | V | F | L | A | T | D | I | N | L | P | G | A | V | D | W | V | M | M | Q | S | C | F | G | F | H | F | M | L | V | L | E | K | Q | E | K | G | H | Q | Q | F | F | A | I | V | Q | L | I | G | T | R | K | Q | A | E | N | F | A | Y | R | L | E | L | N | G | H | R | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | ||||||
Sequence | R | L | T | W | E | A | T | P | R | S | I | H | E | G | I | A | T | A | I | M | N | S | D | C | L | V | F | D | T | S | I | A | Q | L | F | A | E | N | G | N | L | G | I | N | V | T | I | S | M | C | ||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | S | B | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|