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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4i78A_ | PDB header: viral protein | Chain: A: PDB Molecule: hemagglutinin ha1; | PDBTitle: crystal structure of a subtype h17 hemagglutinin homologue from2 a/little yellow-shouldered bat/guatemala/060/2010 (h17n10) |
Added to library: Tue Jan 22 09:03:02 2013 | |
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Sequence | D | R | I | C | I | G | Y | Q | A | N | Q | N | N | Q | T | V | N | T | L | L | E | Q | N | V | P | V | T | G | A | Q | E | I | L | E | T | N | H | N | G | K | L | C | S | L | N | G | V | P | P | L | D | L | Q | S | C | T | L | A | G | W | L | L | G | N | P | N | C | D | N | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | B | S | B | S | S | T | T | B | B | T | T | B | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | E | A | E | E | W | S | Y | I | K | I | N | E | N | A | P | D | D | L | C | F | P | G | N | F | E | N | L | Q | D | L | L | L | E | M | S | G | V | Q | N | F | T | K | V | K | L | F | N | P | Q | S | M | T | G | V | T | T | N | N | V | D | Q | T | C | P | F | E | G | K | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | S | B | S | S | S | T | T | T | S | S | G | G | G | S | S | B | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | F | Y | R | N | L | N | W | I | Q | G | N | S | G | L | P | F | N | I | E | I | K | N | P | T | S | N | P | L | L | L | L | W | G | I | H | N | T | K | D | A | A | Q | Q | R | N | L | Y | G | N | D | Y | S | Y | T | I | F | N | F | G | E | K | S | E | E | F | R | P | D | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | Q | R | D | E | I | K | A | H | Q | D | R | I | D | Y | Y | W | G | S | L | P | A | Q | S | T | L | R | I | E | S | T | G | N | L | I | A | P | E | Y | G | F | Y | Y | K | R | K | E | G | K | G | G | L | M | K | S | K | L | P | I | S | D | C | S | T | K | C | Q | T | P | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | T | B | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||
Sequence | G | A | L | N | S | T | L | P | F | Q | N | V | H | Q | Q | T | I | G | N | C | P | K | Y | V | K | A | T | S | L | M | L | A | T | G | L | R | N | N | P | |||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | B | T | T | S | S | S | S | S | S | S | B |
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