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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4i66A_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: A: PDB Molecule: uncharacterized protein hoch_4089; | PDBTitle: crystal structure of hoch_4089 protein from haliangium ochraceum |
Added to library: Sat Feb 16 08:33:19 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | F | R | F | G | Q | L | A | L | G | D | I | Y | P | Q | A | L | S | R | X | S | R | E | I | D | K | R | T | S | I | E | A | A | R | E | P | A | A | V | T | L | S | S | P | T | L | H | E | T | P | F | L | Y | L | A | G | D | R | E | F | A | I | P | P | E | P | E | V | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | T | T | S | S | S | B | S | S | T | T | T | T | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | R | R | H | L | T | F | G | G | F | L | L | I | D | S | A | E | G | A | L | G | G | A | F | D | R | S | V | R | R | L | L | Q | A | V | F | P | A | P | A | P | G | L | E | I | V | S | G | E | H | V | V | F | K | S | F | Y | L | L | E | R | P | L | G | R | L | A | L | S | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | G | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 |
Sequence | V | X | E | G | I | L | R | D | G | R | L | X | V | A | Y | V | Q | N | D | L | G | G | A | F | A | R | D | D | F | G | N | F | Q | L | A | C | V | P | D | G | E | R | Q | R | E | L | A | F | R | X | L | V | N | L | V | X | Y | A | L | C | ||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | B | T | T | S | S | B | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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