|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4hwyA_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: cysteine peptidase c (cpc); | PDBTitle: trypanosoma brucei procathepsin b solved from 40 fs free-electron2 laser pulse data by serial femtosecond x-ray crystallography |
Added to library: Thu Jan 10 08:05:20 2013 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | E | D | A | P | V | L | S | K | A | F | V | D | R | V | N | R | L | N | R | G | I | W | K | A | K | Y | D | G | V | M | Q | N | I | T | L | R | E | A | K | R | L | N | G | V | I | K | I | L | P | K | R | R | F | T | E | E | E | A | R | A | P | L | P | S | S | F | D | S | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | B | T | B | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | W | P | N | C | P | T | I | P | Q | I | A | D | Q | S | A | C | G | S | C | W | A | V | A | A | A | S | A | M | S | D | R | F | C | T | M | G | G | V | Q | D | V | H | I | S | A | G | D | L | L | A | C | C | S | D | C | G | D | G | C | N | G | G | D | P | D | R | A | W | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | B | S | S | S | T | S | S | S | S | B | G | G | G | B | G | G | G | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | F | S | S | T | G | L | V | S | D | Y | C | Q | P | Y | P | F | P | H | C | S | H | H | S | K | S | K | N | G | Y | P | P | C | S | Q | F | N | F | D | T | P | K | C | N | Y | T | C | D | D | P | T | I | P | V | V | N | Y | R | S | W | T | S | Y | A | L | Q | G | E | D | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | B | T | T | T | S | S | S | B | S | S | S | S | T | T | B | G | G | G | S | S | S | S | T | T | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | Y | M | R | E | L | F | F | R | G | P | F | E | V | A | F | D | V | Y | E | D | F | I | A | Y | N | S | G | V | Y | H | H | V | S | G | Q | Y | L | G | G | H | A | V | R | L | V | G | W | G | T | S | N | G | V | P | Y | W | K | I | A | N | S | W | N | T | E | W | G | M | D | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | B | T | T | S | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Y | F | L | I | R | R | G | S | S | E | C | G | I | E | D | G | G | S | A | G | I | P | L | A | P | N | T | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|