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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4htyA_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: cellulase; | PDBTitle: crystal structure of a metagenome-derived cellulase cel5a |
Added to library: Wed Jan 9 16:40:22 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | W | W | N | A | S | D | I | P | A | F | D | K | S | K | I | T | R | Q | L | P | L | I | K | V | E | G | N | R | F | V | D | E | Q | G | K | T | I | V | F | R | G | V | N | I | S | D | P | D | K | I | D | K | D | K | R | F | S | K | K | H | F | E | V | I | R | S | W | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | T | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | V | V | R | V | P | V | H | P | R | A | W | K | E | R | G | V | K | G | Y | L | E | L | L | D | Q | V | V | A | W | N | N | E | L | G | I | Y | T | I | L | D | W | H | S | I | G | N | L | K | S | E | X | F | Q | N | N | S | Y | H | T | T | K | G | E | T | F | D | F | W | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | V | S | E | R | Y | N | G | I | N | S | V | A | F | Y | E | I | F | N | E | P | T | V | F | N | G | R | L | G | I | A | T | W | A | E | W | K | A | I | N | E | E | A | I | T | I | I | Q | A | H | N | P | K | A | I | A | L | V | A | G | F | N | W | A | Y | D | L | K | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | A | N | P | I | D | R | Q | N | I | A | Y | V | S | H | P | Y | P | Q | K | V | G | A | P | Y | Q | A | N | W | E | R | D | F | G | F | X | A | D | K | Y | P | V | F | A | T | E | I | G | Y | Q | R | A | T | D | K | G | A | H | I | P | V | I | D | D | G | S | Y | G | P | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | G | G | G | G | G | T | S | B | T | T | S | T | T | T | T | S | B | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 |
Sequence | I | T | D | Y | F | N | S | K | G | I | S | W | V | A | W | V | F | D | P | D | W | S | P | Q | L | F | T | D | Y | Q | T | Y | T | P | T | X | Q | G | E | H | F | R | K | V | X | L | Q | D | N | K | ||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | S | S | B | S | T | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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