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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4hteA_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: nicking enzyme; | PDBTitle: crystal structure of the c-terminal domain of nicking enzyme from2 staphylococcus aureus |
Added to library: Mon Feb 4 12:05:24 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | L | N | A | F | S | Y | X | N | K | S | D | S | T | T | L | K | N | X | A | K | D | L | K | I | Y | V | T | P | I | N | X | Y | K | E | N | E | R | L | Y | D | L | K | Q | K | T | S | L | I | T | D | D | E | D | R | L | N | K | I | E | D | I | E | D | R | Q | K | K | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | I | N | E | V | F | E | K | Q | A | G | I | F | F | D | K | N | Y | P | D | Q | S | L | N | Y | S | D | D | E | K | I | F | I | T | R | T | I | L | N | D | R | D | V | L | P | A | N | N | E | L | E | D | I | V | K | E | K | R | I | K | E | A | Q | I | S | L | N | T | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | N | R | D | I | S | L | E | S | I | A | A | A | S | N | F | F | A | D | K | L | S | N | I | L | E | K | N | N | L | S | F | D | D | V | L | E | N | K | H | E | G | X | E | D | S | L | K | I | D | Y | Y | T | N | K | L | E | V | F | R | N | A | E | N | I | L | E | D | Y | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | V | Q | I | K | E | L | F | T | D | D | E | D | Y | K | A | F | N | E | V | T | D | I | K | E | K | Q | Q | L | I | D | F | K | T | Y | H | G | T | E | N | T | I | E | X | L | E | T | G | N | F | I | P | K | Y | S | D | E | D | R | K | Y | I | T | E | Q | V | K | L | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | |||
Sequence | E | K | E | F | K | P | N | K | N | Q | H | D | K | F | V | F | G | A | I | Q | K | K | L | L | S | E | Y | D | F | D | Y | S | D | N | N | D | L | K | H | L | Y | Q | E | S | N | E | V | G | D | E | I | S | K | D | N | I | E | E | F | Y | ||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | T | T | T | S | T |
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