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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4hqnB_ | PDB header: cell adhesion | Chain: B: PDB Molecule: sporozoite surface protein 2; | PDBTitle: crystal structure of manganese-loaded plasmodium vivax trap protein |
Added to library: Wed Jan 9 15:06:32 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | V | D | E | V | K | Y | S | E | E | V | C | N | E | Q | V | D | L | Y | L | L | V | D | G | S | G | S | I | G | Y | P | N | W | I | T | K | V | I | P | M | L | N | G | L | I | N | S | L | S | L | S | R | D | T | I | N | L | Y | M | N | L | F | G | S | Y | T | T | E | L | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | T | T | T | S | B | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | L | G | S | G | Q | S | I | D | K | R | Q | A | L | S | K | V | T | E | L | R | K | T | Y | T | P | Y | G | T | T | S | M | T | A | A | L | D | E | V | Q | K | H | L | N | D | R | V | N | R | E | K | A | I | Q | L | V | I | L | M | T | D | G | V | P | N | S | K | Y | R | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | E | V | A | N | K | L | K | Q | R | N | V | R | L | A | V | I | G | I | G | Q | G | I | N | H | Q | F | N | R | L | I | A | G | C | R | P | R | E | P | N | C | K | F | Y | S | Y | A | D | W | N | E | A | V | A | L | I | K | P | F | I | A | K | V | C | T | E | V | E | R | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | |||||||||
Sequence | A | N | C | G | P | W | D | P | W | T | A | C | S | V | T | C | G | R | G | T | H | S | R | S | R | P | S | L | H | E | K | C | T | T | H | M | V | S | E | C | E | E | G | E | C | P | ||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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