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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4hlqE_ | PDB header: hydrolase activator/protein transport | Chain: E: PDB Molecule: tbc1 domain family member 20; | PDBTitle: crystal structure of human rab1b bound to gdp and bef3 in complex with2 the gap domain of tbc1d20 from homo sapiens |
Added to library: Tue Jan 22 09:06:18 2013 | |
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Sequence | F | N | A | K | R | K | K | K | V | A | E | I | H | Q | A | L | N | S | D | P | T | D | V | A | A | L | R | R | M | A | I | S | E | G | G | L | L | T | D | E | I | R | R | K | V | W | P | K | L | L | N | V | N | A | N | D | P | P | P | I | S | G | K | N | L | R | Q | M | S | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | Y | Q | Q | V | L | L | D | V | R | R | S | L | R | R | F | P | P | G | M | P | E | E | Q | R | E | G | L | Q | E | E | L | I | D | I | I | L | L | I | L | E | R | N | P | Q | L | H | Y | Y | Q | G | Y | H | D | I | V | V | T | F | L | L | V | V | G | E | R | L | A | T | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | V | E | K | L | S | T | H | H | L | R | D | F | M | D | P | T | M | D | N | T | K | H | I | L | N | Y | L | M | P | I | I | D | Q | V | N | P | E | L | H | D | F | M | Q | S | A | E | V | G | T | I | F | A | L | S | W | L | I | T | W | F | G | H | V | L | S | D | F | R | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G | G | G | G | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | V | R | L | Y | D | F | F | L | A | C | H | P | L | M | P | I | Y | F | A | A | V | I | V | L | Y | R | E | Q | E | V | L | D | C | D | C | D | M | A | S | V | H | H | L | L | S | Q | I | P | Q | D | L | P | Y | E | T | L | I | S | R | A | G | D | L | F | V | Q | F | P | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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