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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4hljA_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: roundabout homolog 1; | PDBTitle: axon guidance receptor |
Added to library: Sat Nov 23 08:52:18 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | S | Q | G | V | D | H | K | Q | V | Q | R | E | L | G | N | A | V | L | H | L | H | N | P | T | V | L | S | S | S | S | I | E | V | H | W | T | V | D | Q | Q | S | Q | Y | I | Q | G | Y | K | I | L | Y | R | P | S | G | A | N | H | G | E | S | D | W | L | V | F | E | V | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | P | A | K | N | S | V | V | I | P | D | L | R | K | G | V | N | Y | E | I | K | A | R | P | F | F | N | E | F | Q | G | A | D | S | E | I | K | F | A | K | T | L | E | E | A | P | S | A | P | P | Q | G | V | T | V | S | K | N | D | T | A | I | L | V | S | W | Q | P | P | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | D | T | Q | N | G | M | V | Q | E | Y | K | V | W | C | L | G | N | E | T | R | Y | H | I | N | K | T | V | D | G | S | T | F | S | V | V | I | P | F | L | V | P | G | I | R | Y | S | V | E | V | A | A | S | T | G | A | G | S | G | V | K | S | E | P | Q | F | I | Q | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | H | G | N | P | V | S | P | E | D | R | V | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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