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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4hh5A_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: putative type vi secretion protein; | PDBTitle: n-terminal domain (1-163) of clpv1 atpase from e.coli eaec sci1 t6ss. |
Added to library: Sat Nov 23 08:26:33 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | V | N | N | M | E | N | S | A | A | L | L | R | R | L | N | H | Y | C | A | R | A | L | E | G | A | A | S | L | C | Q | T | R | A | H | A | E | I | T | P | E | H | W | L | L | K | L | L | E | Q | G | E | G | D | L | T | V | L | G | R | R | Y | D | W | D | M | D | A | I | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | S | L | L | G | W | L | D | N | Q | P | R | S | V | R | S | R | P | Q | L | A | Q | S | L | N | A | L | L | K | Q | A | W | M | V | A | S | L | Q | G | E | E | H | I | R | S | V | H | L | L | G | A | L | T | E | N | P | H | L | V | R | C | D | G | L | W | P | L | L | T | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | T | S | S | B | S | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | Q | S | Q | L | Q | R | L | S | P | L | L | D | A | Q | S | D | E | C | P | E | T | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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