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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4hbdA_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: kn motif and ankyrin repeat domain-containing protein 2; | PDBTitle: crystal structure of kank2 ankyrin repeats |
Added to library: Wed Jan 9 22:07:01 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | E | L | S | P | D | L | I | S | A | C | L | A | L | E | K | Y | L | D | N | P | N | A | L | T | E | R | E | L | K | V | A | Y | T | T | V | L | Q | E | W | L | R | L | A | C | R | S | D | A | H | P | E | L | V | R | R | H | L | V | T | F | R | A | M | S | A | R | L | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | V | V | N | I | A | D | S | N | G | N | T | A | L | H | Y | S | V | S | H | A | N | F | P | V | V | Q | Q | L | L | D | S | G | V | C | K | V | D | K | Q | N | R | A | G | Y | S | P | I | M | L | T | A | L | A | T | L | K | T | Q | D | D | I | E | T | V | L | Q | L | F | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | S | T | T | T | T | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | G | N | I | N | A | K | A | S | Q | A | G | Q | T | A | L | M | L | A | V | S | H | G | R | V | D | V | V | K | A | L | L | A | C | E | A | D | V | N | V | Q | D | D | D | G | S | T | A | L | M | C | A | C | E | H | G | H | K | E | I | A | G | L | L | L | A | V | P | S | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||
Sequence | D | I | S | L | T | D | R | D | G | S | T | A | L | M | V | A | L | D | A | G | Q | S | E | I | A | S | M | L | Y | S | R | M | N | I | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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