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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4gu4B_ | PDB header: viral protein | Chain: B: PDB Molecule: outer capsid protein sigma-1; | PDBTitle: crystal structure of the t1l reovirus attachment protein sigma1 in2 complex with alpha-2,3-sialyllactose |
Added to library: Thu Jan 10 06:41:15 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | I | D | S | V | L | P | P | L | T | V | R | E | A | S | G | V | R | T | L | S | F | G | Y | D | T | S | D | F | T | I | I | N | S | V | L | S | L | R | S | R | L | T | L | P | T | Y | R | Y | P | L | E | L | D | T | A | N | N | R | V | Q | V | A | D | R | F | G | M | R | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | T | W | T | G | Q | L | Q | Y | Q | H | P | Q | L | S | W | R | A | N | V | T | L | N | L | M | K | V | D | D | W | L | V | L | S | F | S | Q | M | T | T | N | S | I | M | A | D | G | K | F | V | I | N | F | V | S | G | L | S | S | G | W | Q | T | G | D | T | E | P | S | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | S | B | T | T | G | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . |
Sequence | T | I | D | P | L | S | T | T | F | A | A | V | Q | F | L | N | N | G | Q | R | I | D | A | F | R | I | M | G | V | S | E | W | T | D | G | E | L | E | I | K | N | Y | G | G | T | Y | T | G | H | T | Q | V | Y | W | A | P | W | T | I | M | Y | P | C | N | V | |||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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