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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4gslD_ | PDB header: protein transport | Chain: D: PDB Molecule: autophagy-related protein 3; | PDBTitle: crystal structure of an atg7-atg3 crosslinked complex |
Added to library: Thu Jan 10 05:45:39 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | F | L | T | T | G | Q | I | T | P | E | E | F | V | Q | A | G | D | Y | L | A | H | M | F | P | T | W | K | W | N | E | E | S | S | D | I | S | Y | R | D | F | L | P | K | N | K | Q | F | L | I | I | R | K | V | P | A | D | K | R | A | E | Q | A | I | D | E | L | I | Q | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | B | T | T | S | T | T | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | M | E | I | A | Q | E | R | Y | Y | D | L | Y | I | A | Y | S | T | S | Y | R | V | P | K | M | Y | I | V | G | F | N | S | N | G | S | P | L | S | P | E | Q | M | F | E | D | I | S | A | D | Y | R | T | K | T | A | T | I | E | K | L | P | F | Y | K | N | S | V | L | S | V | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | B | G | G | G | S | T | T | S | T | T | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | ||||||||
Sequence | I | H | P | C | K | H | A | N | V | M | K | I | L | L | D | K | V | R | V | D | Q | Y | L | I | V | F | L | K | F | I | T | S | V | T | P | S | I | Q | H | D | ||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | G | G | G | S | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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