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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4gq7A_ | PDB header: sugar binding protein | Chain: A: PDB Molecule: flocculin; | PDBTitle: crystal structure of lg-flo1p |
Added to library: Tue Jan 22 09:04:19 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | E | A | T | Q | A | C | L | P | V | G | S | R | K | N | G | M | N | V | N | F | Y | K | Y | S | L | Q | D | S | T | T | Y | S | D | P | Q | Y | M | A | Y | K | Y | S | D | T | K | K | L | G | S | V | S | G | Q | T | H | L | S | I | Y | Y | G | P | N | T | A | F | W | N | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | G | G | G | T | G | G | G | G | S | B | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | S | W | S | S | D | L | F | G | F | Y | T | T | P | T | N | V | T | V | E | M | T | G | Y | F | L | P | P | Q | T | G | S | Y | T | F | K | F | A | T | V | D | D | S | A | I | L | S | V | G | G | S | I | A | F | E | C | C | A | Q | E | Q | P | P | I | T | S | T | D | F | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | T | T | T | T | B | T | T | S | S | S | S | B | S | S | B | T | T | T | B | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | N | G | I | K | P | W | D | A | A | A | P | T | D | I | K | G | S | T | Y | M | Y | A | G | Y | Y | Y | P | I | K | I | V | Y | S | N | A | K | A | L | A | R | L | P | V | S | V | V | L | P | D | G | T | E | V | N | D | D | F | E | G | Y | V | Y | S | F | D | D | D | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | B | S | S | T | T | S | S | B | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Q | S | N | C | T | I | P | D | P | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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