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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4gprA_ | PDB header: ligase | Chain: A: PDB Molecule: ubiquitin-conjugating enzyme family protein; | PDBTitle: crystal structure of ehubc5, a ubiquitin conjugating enzyme from2 entamoeba histolytica |
Added to library: Wed Jan 9 14:32:51 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | A | M | A | M | R | R | I | Q | K | E | L | R | E | I | Q | Q | D | P | P | C | N | C | S | A | G | P | V | G | D | D | I | F | H | W | T | A | T | I | T | G | P | D | D | S | P | Y | Q | G | G | L | F | F | L | D | V | H | F | P | V | D | Y | P | F | K | A | P | R | V | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | M | T | K | V | Y | H | P | N | I | N | K | N | G | V | I | C | L | D | I | L | K | D | Q | W | S | P | A | L | T | L | S | R | V | L | L | S | I | S | S | L | L | T | D | P | N | P | S | D | P | L | D | P | E | V | A | N | V | L | R | A | N | K | K | Q | F | E | D | T | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | B | T | T | B | B | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | E | W | T | R | M | Y | A | R | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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