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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4gmvB_ | PDB header: cell adhesion | Chain: B: PDB Molecule: ras-associated and pleckstrin homology domains-containing | PDBTitle: crystal structure of the coiled-coil, ra and ph domains of2 lamellipodin |
Added to library: Wed Jan 9 20:33:25 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | A | E | K | I | R | V | A | L | E | K | I | K | E | A | Q | V | K | K | L | V | I | R | V | H | M | S | D | D | S | S | K | T | M | M | V | D | E | R | Q | T | V | R | Q | V | L | D | N | L | M | D | K | S | H | C | G | Y | S | L | D | W | S | L | V | E | T | V | S | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | S | T | T | S | T | T | B | S | S | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | M | E | R | I | F | E | D | H | E | N | L | V | E | N | L | L | N | W | T | R | D | S | Q | N | K | L | I | F | M | E | R | I | E | K | Y | A | L | F | K | N | P | Q | N | Y | L | L | G | K | K | E | T | A | E | M | A | D | R | N | K | E | V | L | L | E | E | C | F | C | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | B | T | T | S | T | T | G | G | G | G | G | G | G | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | S | V | T | V | P | E | I | E | G | V | L | W | L | K | D | D | G | K | K | S | W | K | K | R | Y | F | L | L | R | A | S | G | I | Y | Y | V | P | D | L | V | C | F | L | Q | L | D | H | V | N | V | Y | Y | G | Q | D | Y | R | N | K | Y | K | A | P | T | D | Y | C | L | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | ||
Sequence | L | K | H | P | Q | I | Q | K | K | S | Q | Y | I | K | Y | L | C | C | D | D | V | R | T | L | H | Q | W | V | N | G | I | R | I | A | K | Y | G | K | Q | L | Y | M | N | Y | Q | E | A | L | K | R | T | |||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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