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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4gkzA_ | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: alpha chain of class ii tcr; | PDBTitle: ha1.7, a mhc class ii restricted tcr specific for haemagglutinin |
Added to library: Thu Jan 10 07:42:54 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | Q | S | V | T | Q | L | G | S | H | V | S | V | S | E | G | A | L | V | L | L | R | C | N | Y | S | S | S | V | P | P | Y | L | F | W | Y | V | Q | Y | P | N | Q | G | L | Q | L | L | L | K | Y | T | S | A | A | T | L | V | K | G | I | N | G | F | E | A | E | F | K | K | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | T | S | F | H | L | T | K | P | S | A | H | M | S | D | A | A | E | Y | F | C | A | V | S | E | S | P | F | G | N | E | K | L | T | F | G | T | G | T | R | L | T | I | I | P | N | I | Q | N | P | D | P | A | V | Y | Q | L | R | D | S | K | S | S | D | K | S | V | C | L | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . |
Sequence | T | D | F | D | S | Q | T | N | V | S | Q | S | K | D | S | D | V | Y | I | T | D | K | C | V | L | D | M | R | S | M | D | F | K | S | N | S | A | V | A | W | S | N | K | S | D | F | A | C | A | N | A | F | N | N | S | I | I | P | E | D | T | F | ||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | G | G | G | T | T | B | T | T | B | T | T | T | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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