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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4gjhB_ | PDB header: immune system | Chain: B: PDB Molecule: tnf receptor-associated factor 5; | PDBTitle: crystal structure of the traf domain of traf5 |
Added to library: Wed Jan 9 17:12:45 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | H | K | A | Q | L | N | K | N | E | E | R | F | K | Q | L | E | G | A | C | Y | S | G | K | L | I | W | K | V | T | D | Y | R | V | K | K | R | E | A | V | E | G | H | T | V | S | V | F | S | Q | P | F | Y | T | S | R | C | G | Y | R | L | C | A | R | A | Y | L | N | G | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | S | G | K | G | T | H | L | S | L | Y | F | V | V | M | R | G | E | F | D | S | L | L | Q | W | P | F | R | Q | R | V | T | L | M | L | L | D | Q | S | G | K | K | N | H | I | V | E | T | F | K | A | D | P | N | S | S | S | F | K | R | P | D | G | E | M | N | I | A | S | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | T | G | G | G | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | |||||
Sequence | C | P | R | F | V | S | H | S | T | L | E | N | S | K | N | T | Y | I | K | D | D | T | L | F | L | K | V | A | V | D | L | T | D | L | E | D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | B | T | T | B | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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