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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4gdkB_ | PDB header: protein binding | Chain: B: PDB Molecule: autophagy protein 5; | PDBTitle: crystal structure of human atg12~atg5 conjugate in complex with an n-2 terminal fragment of atg16l1 |
Added to library: Wed Jan 9 15:14:11 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | D | K | D | V | L | R | D | V | W | F | G | R | I | P | T | C | F | T | L | Y | Q | D | E | I | T | E | R | E | A | E | P | Y | Y | L | L | L | P | R | V | S | Y | L | T | L | V | T | D | K | V | K | K | H | F | Q | K | V | M | R | Q | E | D | I | S | E | I | W | F | E | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | G | T | P | L | K | W | H | Y | P | I | G | L | L | F | D | L | L | A | S | S | S | A | L | P | W | N | I | T | V | H | F | K | S | F | P | E | K | D | L | L | H | C | P | S | K | D | A | I | E | A | H | F | M | S | C | M | K | E | A | D | A | L | K | H | K | S | Q | V | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | E | M | Q | K | K | D | H | K | Q | L | W | M | G | L | Q | N | D | R | F | D | Q | F | W | A | I | N | R | K | L | M | E | Y | P | A | E | E | N | G | F | R | Y | I | P | F | R | I | Y | Q | T | T | T | E | R | P | F | I | Q | K | L | F | R | P | V | A | A | D | G | Q | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | T | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | B | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | H | T | L | G | D | L | L | K | E | V | C | P | S | A | I | D | K | N | Q | V | M | I | H | G | I | E | P | M | L | E | T | P | L | Q | W | L | S | E | H | L | S | Y | P | D | N | F | L | H | I | S | I | I | P | Q | P | T | D | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | B | T | T | B | T | T | S | B | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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