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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4gaoA_ | PDB header: ligase/peptide | Chain: A: PDB Molecule: dcn1-like protein 2; | PDBTitle: dcnl complex with n-terminally acetylated nedd8 e2 peptide |
Added to library: Wed Jan 9 19:45:29 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | S | K | K | K | L | E | R | L | Y | G | R | Y | K | D | P | Q | D | E | N | K | I | G | V | D | G | I | Q | Q | F | C | D | D | L | S | L | D | P | A | S | I | S | V | L | V | I | A | W | K | F | R | A | A | T | Q | C | E | F | S | R | K | E | F | L | D | G | M | T | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | C | D | S | M | E | K | L | K | A | L | L | P | R | L | E | Q | E | L | K | D | T | A | K | F | K | D | F | Y | Q | F | T | F | T | F | A | K | N | P | G | Q | K | G | L | D | L | E | M | A | V | A | Y | W | K | L | V | L | S | G | R | F | K | F | L | D | L | W | N | T | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | G | G | G | S | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . |
Sequence | L | M | E | H | H | K | R | S | I | P | R | D | T | W | N | L | L | L | D | F | G | N | M | I | A | D | D | M | S | N | Y | D | E | E | G | A | W | P | V | L | I | D | D | F | V | E | Y | A | R | P | V | V | T | |||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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