|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4g8kA_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: 2-5a-dependent ribonuclease; | PDBTitle: intact sensor domain of human rnase l in the inactive signaling state |
Added to library: Sat Nov 3 16:52:24 2012 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | A | A | V | E | D | N | H | L | L | I | K | A | V | Q | N | E | D | V | D | L | V | Q | Q | L | L | E | G | G | A | N | V | N | F | Q | E | E | E | G | G | W | T | P | L | H | N | A | V | Q | M | S | R | E | D | I | V | E | L | L | L | R | H | G | A | D | P | V | L | R | K | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | G | A | T | P | F | I | L | A | A | I | A | G | S | V | K | L | L | K | L | F | L | S | K | G | A | D | V | N | E | C | D | F | Y | G | F | T | A | F | M | E | A | A | V | Y | G | K | V | K | A | L | K | F | L | Y | K | R | G | A | N | V | N | L | R | R | K | T | K | L | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | B | T | T | B | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | G | G | A | T | A | L | M | D | A | A | E | K | G | H | V | E | V | L | K | I | L | L | D | E | M | G | A | D | V | N | A | C | D | N | M | G | R | N | A | L | I | H | A | L | L | S | S | D | D | S | D | V | E | A | I | T | H | L | L | L | D | H | G | A | D | V | N | V | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | S | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | E | R | G | K | T | P | L | I | L | A | V | E | K | K | H | L | G | L | V | Q | R | L | L | E | Q | E | H | I | E | I | N | D | T | D | S | D | G | K | T | A | L | L | L | A | V | E | L | K | L | K | K | I | A | E | L | L | C | K | R | G | A | S | T | D | C | G | D | L | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | S | T | T | T | T | B | T | T | S | B | T | T | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | ||||||||||||||||||||||
Sequence | M | T | A | R | R | N | Y | D | H | S | L | V | K | V | L | L | S | H | G | A | K | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|