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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4g1uB_ | PDB header: transport protein/hydrolase | Chain: B: PDB Molecule: hemin transport system permease protein hmuu; | PDBTitle: x-ray structure of the bacterial heme transporter hmuuv from yersinia2 pestis |
Added to library: Thu Jan 10 12:33:55 2013 | |
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Sequence | R | V | Q | P | R | L | M | L | G | F | L | L | I | L | L | V | I | L | A | L | G | S | A | N | M | W | H | I | W | L | N | I | R | L | P | R | V | L | L | A | V | V | V | G | C | A | L | A | V | S | G | T | I | M | Q | G | L | F | R | N | P | L | A | D | P | G | L | L | G | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | S | G | A | A | L | C | V | G | L | I | I | V | M | L | A | L | Y | S | H | M | V | G | A | F | I | G | S | L | A | I | S | T | I | I | F | T | L | S | R | W | G | H | G | N | L | A | R | L | L | L | A | G | I | A | I | N | A | L | C | G | A | A | V | G | V | L | T | Y | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | D | D | Q | Q | L | R | Q | F | S | L | W | S | M | G | S | L | G | Q | A | Q | W | S | T | L | L | V | A | S | S | L | I | L | P | T | C | I | L | G | L | L | Q | A | R | Q | L | N | L | L | Q | L | G | D | E | E | A | H | Y | L | G | V | N | V | R | Q | A | K | L | R | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | L | L | S | A | I | L | I | G | A | A | V | A | V | S | G | V | I | G | F | I | G | L | V | V | P | H | L | I | R | M | R | I | G | A | D | H | R | W | L | L | P | G | A | A | L | G | G | A | C | L | L | L | T | A | D | T | L | A | R | T | L | V | A | P | A | E | M | P | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | L | L | T | S | L | L | G | G | P | Y | F | L | W | L | I | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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