|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4fuoA_ | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: accumulation associated protein; | PDBTitle: structural basis for zn2+-dependent intercellular adhesion in2 staphylococcal biofilms |
Added to library: Tue Jan 22 09:03:37 2013 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | V | D | G | D | P | I | T | S | T | E | E | I | P | F | D | K | K | R | E | F | D | P | N | L | A | P | G | T | E | K | V | V | Q | K | G | E | P | G | T | K | T | I | T | T | P | T | T | K | N | P | L | T | G | E | K | V | E | G | E | P | T | E | K | I | T | K | Q | P | V | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | B | B | T | T | T | B | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | I | V | H | Y | G | G | E | Q | I | P | Q | G | H | K | D | E | F | D | P | N | A | P | V | D | S | K | T | E | V | P | G | K | P | G | V | K | N | P | D | T | G | E | V | V | T | P | P | V | D | D | V | T | K | Y | G | P | V | D | G | D | S | I | T | S | T | E | E | I | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | B | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | F | D | K | K | R | E | F | D | P | N | L | A | P | G | T | E | K | V | V | Q | K | G | E | P | G | T | K | T | I | T | T | P | T | T | K | N | P | L | T | G | E | K | V | G | E | G | K | S | T | E | K | V | T | K | Q | P | V | D | E | I | V | E | Y | G | P | T | ||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | B | T | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|