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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ftfA_ | PDB header: protein transport | Chain: A: PDB Molecule: alternate secretin pathway subunit s (vc395_1821, vc1703); | PDBTitle: structure of the type ii secretion system pilotin asps from vibrio2 cholerae |
Added to library: Wed Jan 9 17:39:54 2013 | |
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Sequence | G | A | M | A | E | K | Q | R | N | L | E | L | L | A | G | N | R | A | S | L | L | S | T | E | L | P | L | E | F | G | P | L | N | I | L | R | A | T | A | K | G | S | T | V | E | L | M | M | V | Y | N | T | D | A | N | N | A | K | P | T | E | Q | V | L | Q | S | A | V | S | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||
Sequence | F | C | A | N | K | D | I | R | S | N | L | D | V | G | I | S | Y | R | I | Q | M | R | N | T | R | G | Q | L | M | A | D | Q | L | V | T | K | E | S | C | |||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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