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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4fqgB_ | PDB header: transcription | Chain: B: PDB Molecule: transcription elongation regulator 1; | PDBTitle: crystal structure of the tcerg1 ff4-6 tandem repeat domain |
Added to library: Sat Mar 2 08:30:08 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | H | M | K | R | E | E | A | I | Q | N | F | K | A | L | L | S | D | M | V | R | S | S | D | V | S | W | S | D | T | R | R | T | L | R | K | D | H | R | W | E | S | G | S | L | L | E | R | E | E | K | E | K | L | F | N | E | H | I | E | A | L | T | K | K | K | R | E | H | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | G | G | G | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | Q | L | L | D | E | T | S | A | I | T | L | T | S | T | W | K | E | V | K | K | I | I | K | E | D | P | R | C | I | K | F | S | S | S | D | R | K | K | Q | R | E | F | E | E | Y | I | R | D | K | Y | I | T | A | K | A | D | F | R | T | L | L | K | E | T | K | F | I | T | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||
Sequence | R | S | K | K | L | I | Q | E | S | D | Q | H | L | K | D | V | E | K | I | L | Q | N | D | K | R | Y | L | V | L | D | C | V | P | E | E | R | R | K | L | I | V | A | Y | V | D | D | L | D | R | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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