|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4fqeA_ | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: oligogalacturonate-specific porin kdgm; | PDBTitle: kdgm porin |
Added to library: Sat Jun 29 08:22:20 2013 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | V | S | I | D | Y | R | H | E | M | Q | D | G | H | K | D | R | L | L | I | S | H | R | F | A | N | G | F | G | L | S | S | E | V | K | W | A | Q | V | S | N | G | T | E | V | V | A | S | Y | V | Y | K | F | N | S | V | F | S | I | E | P | G | F | S | L | E | S | G | S | S | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | N | Y | R | P | Y | L | R | G | R | A | N | V | T | D | D | L | S | V | A | L | R | Y | R | P | Y | F | K | R | K | G | Y | T | L | T | G | N | I | D | Y | T | F | L | K | D | Y | T | I | G | Y | E | L | E | Y | K | K | G | T | S | Y | D | I | T | H | N | V | K | L | S | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | W | D | K | N | W | K | P | Y | V | E | V | G | N | V | S | R | Q | T | R | Y | R | V | G | V | Q | Y | S | F | H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|