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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4fomA_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: poliovirus receptor-related protein 3; | PDBTitle: crystal structure of human nectin-3 full ectodomain (d1-d3) |
Added to library: Sat Aug 25 15:35:36 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | P | I | I | V | E | P | H | V | T | A | V | W | G | K | N | V | S | L | K | C | L | I | E | V | N | E | T | I | T | Q | I | S | W | E | K | I | H | G | K | S | S | Q | T | V | A | V | H | H | P | Q | Y | G | F | S | V | Q | G | E | Y | Q | G | R | V | L | F | K | N | Y | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | T | T | S | B | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | N | D | A | T | I | T | L | H | N | I | G | F | S | D | S | G | K | Y | I | C | K | A | V | T | F | P | L | G | N | A | Q | S | S | T | T | V | T | V | L | V | E | P | T | V | S | L | I | K | G | P | D | S | L | I | D | G | G | N | E | T | V | A | A | I | C | I | A | A | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | G | G | G | T | T | T | B | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | K | P | V | A | H | I | D | W | E | G | D | L | G | E | M | E | S | T | T | T | S | F | P | N | E | T | A | T | I | I | S | Q | Y | K | L | F | P | T | R | F | A | R | G | R | R | I | T | C | V | V | K | H | P | A | L | E | K | D | I | R | Y | S | F | I | L | D | I | Q | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | B | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | P | E | V | S | V | T | G | Y | D | G | N | W | F | V | G | R | K | G | V | N | L | K | C | N | A | D | A | N | P | P | P | F | K | S | V | W | S | R | L | D | G | Q | W | P | D | G | L | L | A | S | D | N | T | L | H | F | V | H | P | L | T | F | N | Y | S | G | V | Y | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | T | T | S | S | B | S | S | S | S | S | B | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | C | K | V | T | N | S | L | G | Q | R | S | D | Q | K | V | I | Y | I | S | D | P | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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