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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4fn0B_ | PDB header: cell adhesion | Chain: B: PDB Molecule: poliovirus receptor-related protein 2; | PDBTitle: crystal structure of mouse nectin-2 extracellular fragment d1-d2, 2nd2 crystal form |
Added to library: Sat Aug 25 14:40:30 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | D | V | R | V | R | V | L | P | E | V | R | G | R | L | G | G | T | V | E | L | P | C | H | L | L | P | P | T | T | E | R | V | S | Q | V | T | W | Q | R | L | D | G | T | V | V | A | A | F | H | P | S | F | G | V | D | F | P | N | S | Q | F | S | K | D | R | L | S | F | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | A | R | P | E | T | N | A | D | L | R | D | A | T | L | A | F | R | G | L | R | V | E | D | E | G | N | Y | T | C | E | F | A | T | F | P | N | G | T | R | R | G | V | T | W | L | R | V | I | A | Q | P | E | N | H | A | E | A | Q | E | V | T | I | G | P | Q | S | V | A | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | B | S | G | G | G | T | T | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | R | C | V | S | T | G | G | R | P | P | A | R | I | T | W | I | S | S | L | G | G | E | A | K | D | T | Q | E | P | G | I | Q | A | G | T | V | T | I | I | S | R | Y | S | L | V | P | V | G | R | A | D | G | V | K | V | T | C | R | V | E | H | E | S | F | E | E | P | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | S | T | T | G | G | G | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | P | V | T | L | S | V | R | Y | H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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