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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4fmzA_ | PDB header: cell adhesion, cell invasion | Chain: A: PDB Molecule: internalin; | PDBTitle: crystal structure of an internalin (inlf) from listeria monocytogenes2 str. 4b f2365 at 1.91 a resolution |
Added to library: Sat Aug 4 14:03:19 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | L | A | T | L | P | A | P | I | N | Q | I | F | P | D | A | D | L | A | E | G | I | R | A | V | L | Q | K | A | S | V | T | D | V | V | T | Q | E | E | L | E | S | I | T | K | L | V | V | A | G | E | K | V | A | S | I | Q | G | I | E | Y | L | T | N | L | E | Y | L | N | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | u | n | d | e | f | i | n | e | d |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | G | N | Q | I | T | D | I | S | P | L | S | N | L | V | K | L | T | N | L | Y | I | G | T | N | K | I | T | D | I | S | A | L | Q | N | L | T | N | L | R | E | L | Y | L | N | E | D | N | I | S | D | I | S | P | L | A | N | L | T | K | X | Y | S | L | N | L | G | A | N | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | L | S | D | L | S | P | L | S | N | X | T | G | L | N | Y | L | T | V | T | E | S | K | V | K | D | V | T | P | I | A | N | L | T | D | L | Y | S | L | S | L | N | Y | N | Q | I | E | D | I | S | P | L | A | S | L | T | S | L | H | Y | F | T | A | Y | V | N | Q | I | T | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | T | P | V | A | N | X | T | R | L | N | S | L | K | I | G | N | N | K | I | T | D | L | S | P | L | A | N | L | S | Q | L | T | W | L | E | I | G | T | N | Q | I | S | D | I | N | A | V | K | D | L | T | K | L | K | X | L | N | V | G | S | N | Q | I | S | D | I | S | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | |||||||||
Sequence | N | N | L | S | Q | L | N | S | L | F | L | N | N | N | Q | L | G | N | E | D | X | E | V | I | G | G | L | T | N | L | T | T | L | F | L | S | Q | N | H | I | T | D | I | R | P | L | A | S | L | S | K | X | D | S | A | D | F | A | N | Q | ||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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