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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4fmmA_ | PDB header: lipid binding protein | Chain: A: PDB Molecule: phosphatidylinositol transfer protein pdr16; | PDBTitle: dimeric sec14 family homolog 3 from saccharomyces cerevisiae presents2 some novel features of structure that lead to a surprising "dimer-3 monomer" state change induced by substrate binding |
Added to library: Sat Mar 2 08:29:53 2013 | |
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Sequence | P | K | N | L | I | N | I | D | K | P | I | K | E | L | P | A | S | I | A | I | P | K | E | K | P | L | T | G | E | Q | Q | K | M | Y | D | E | V | L | K | H | F | S | N | P | D | L | K | V | Y | T | S | E | K | N | K | S | E | D | D | L | K | P | L | E | E | E | E | K | A | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | T | R | E | C | F | L | R | Y | L | R | A | T | K | W | V | L | K | D | C | I | D | R | I | T | M | T | L | A | W | R | R | E | F | G | I | S | H | L | G | E | E | H | G | D | K | I | T | A | D | L | V | A | V | E | N | E | S | G | K | Q | V | I | L | G | Y | E | N | D | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | S | S | G | G | G | T | S | S | G | G | G | G | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | P | I | L | Y | L | K | P | G | R | Q | N | T | K | T | S | H | R | Q | V | Q | H | L | V | F | M | L | E | R | V | I | D | F | M | P | A | G | Q | D | S | L | A | L | L | I | D | F | K | D | Y | P | D | V | P | K | V | P | I | G | V | G | K | E | V | L | H | I | L | Q | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | T | T | T | - | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | H | Y | P | E | R | L | G | K | A | L | L | T | N | I | P | W | L | A | W | T | F | L | K | L | I | H | P | F | I | D | P | L | T | R | E | K | L | V | F | D | E | P | F | V | K | Y | V | P | K | N | E | L | D | S | L | Y | G | G | D | L | K | F | K | Y | N | H | D | V | Y | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | G | G | G | S | T | T | S | S | G | G | G | T | S | G | G | G | S | B | G | G | G | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . |
Sequence | P | A | L | V | E | T | A | R | E | K | R | D | H | Y | F | K | R | F | Q | S | F | G | G | I | V | G | L | S | E | V | D | L | R | G | T | H | E | K | L | L | Y | P | V | K | ||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S |
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